MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methylomicrobium alcaliphilum chromosome

Total Repeats: 14022

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016112	GCG	2	6	467218	467223	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1502	NC_016112	AGT	2	6	467336	467341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1503	NC_016112	GCG	2	6	467349	467354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1504	NC_016112	TCGC	2	8	467361	467368	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1505	NC_016112	GCT	2	6	467408	467413	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1506	NC_016112	CAA	2	6	467456	467461	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1507	NC_016112	GCC	2	6	467509	467514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1508	NC_016112	GTA	2	6	468759	468764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1509	NC_016112	ATT	2	6	468765	468770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1510	NC_016112	TAT	2	6	468915	468920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1511	NC_016112	G	6	6	471792	471797	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_016112	ACA	2	6	471859	471864	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1513	NC_016112	GAG	2	6	471873	471878	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1514	NC_016112	CGAC	2	8	471891	471898	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
1515	NC_016112	CGG	2	6	471905	471910	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1516	NC_016112	GCC	2	6	471922	471927	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1517	NC_016112	G	6	6	474027	474032	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1518	NC_016112	TGG	2	6	474034	474039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_016112	GAA	2	6	474082	474087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1520	NC_016112	A	6	6	474139	474144	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1521	NC_016112	TCA	2	6	474167	474172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1522	NC_016112	AGC	2	6	477692	477697	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1523	NC_016112	AGG	2	6	477735	477740	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1524	NC_016112	CGG	2	6	477766	477771	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1525	NC_016112	GCC	2	6	477780	477785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1526	NC_016112	TTTA	2	8	477891	477898	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1527	NC_016112	CCT	2	6	477939	477944	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1528	NC_016112	ATATGG	2	12	478925	478936	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1529	NC_016112	GC	3	6	478944	478949	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1530	NC_016112	CCT	2	6	479096	479101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1531	NC_016112	TA	3	6	479133	479138	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1532	NC_016112	T	6	6	479215	479220	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1533	NC_016112	AGG	2	6	479243	479248	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1534	NC_016112	GCA	2	6	479276	479281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1535	NC_016112	TTTA	2	8	479397	479404	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1536	NC_016112	CAT	2	6	479467	479472	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1537	NC_016112	AAT	2	6	479473	479478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1538	NC_016112	CCT	2	6	480722	480727	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1539	NC_016112	GAA	2	6	480773	480778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1540	NC_016112	CAA	2	6	481202	481207	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1541	NC_016112	CTT	2	6	482079	482084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1542	NC_016112	TTC	2	6	482551	482556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1543	NC_016112	TTAAG	2	10	482600	482609	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_016112	CAC	2	6	482695	482700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1545	NC_016112	CTTAA	2	10	482707	482716	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1546	NC_016112	ATC	2	6	482893	482898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1547	NC_016112	TTG	2	6	482913	482918	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_016112	ATT	2	6	482921	482926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_016112	TCC	2	6	483011	483016	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1550	NC_016112	ATA	2	6	483024	483029	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1551	NC_016112	TTTA	2	8	483195	483202	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1552	NC_016112	CTG	2	6	483250	483255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1553	NC_016112	ATCGA	2	10	483279	483288	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1554	NC_016112	AT	4	8	483306	483313	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_016112	TTG	2	6	483327	483332	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_016112	TAA	2	6	483380	483385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1557	NC_016112	AAC	2	6	483514	483519	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1558	NC_016112	CAA	2	6	483568	483573	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1559	NC_016112	A	8	8	484576	484583	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1560	NC_016112	ATGG	2	8	486505	486512	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1561	NC_016112	TTC	2	6	486537	486542	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1562	NC_016112	AC	3	6	486659	486664	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1563	NC_016112	CTT	2	6	486677	486682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1564	NC_016112	CTCG	3	12	486723	486734	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1565	NC_016112	TCTT	2	8	486740	486747	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1566	NC_016112	TAA	2	6	486854	486859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1567	NC_016112	TTTCA	2	10	486937	486946	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1568	NC_016112	ATG	2	6	486959	486964	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1569	NC_016112	TCGA	2	8	489393	489400	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1570	NC_016112	CGG	2	6	489408	489413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1571	NC_016112	GCC	2	6	489422	489427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1572	NC_016112	ACT	2	6	489552	489557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1573	NC_016112	ACGTT	2	10	489592	489601	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1574	NC_016112	GA	3	6	495433	495438	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1575	NC_016112	CGAT	2	8	495473	495480	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1576	NC_016112	TTTA	2	8	495494	495501	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1577	NC_016112	TGG	2	6	496531	496536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_016112	TTC	2	6	496765	496770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1579	NC_016112	A	6	6	496782	496787	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1580	NC_016112	CCCGC	2	10	496902	496911	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
1581	NC_016112	CGAG	2	8	496993	497000	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1582	NC_016112	G	6	6	497003	497008	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1583	NC_016112	TTC	2	6	497098	497103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1584	NC_016112	CCCGC	2	10	497233	497242	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
1585	NC_016112	A	6	6	497247	497252	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1586	NC_016112	GAGG	2	8	498560	498567	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_016112	CGG	2	6	498678	498683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1588	NC_016112	ATGG	2	8	498696	498703	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1589	NC_016112	CTGCC	2	10	498734	498743	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
1590	NC_016112	TCGA	2	8	498755	498762	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1591	NC_016112	GCTA	2	8	498838	498845	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1592	NC_016112	T	6	6	498908	498913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1593	NC_016112	ATA	2	6	498934	498939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1594	NC_016112	TGGT	2	8	501372	501379	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1595	NC_016112	AT	3	6	501409	501414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1596	NC_016112	TCT	2	6	501475	501480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1597	NC_016112	TCA	2	6	501510	501515	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1598	NC_016112	GGGGTG	2	12	501537	501548	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
1599	NC_016112	CGG	2	6	501660	501665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1600	NC_016112	GCC	2	6	501674	501679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1601	NC_016112	GTCG	2	8	501687	501694	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1602	NC_016112	CTT	2	6	501737	501742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1603	NC_016112	CTA	2	6	501773	501778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1604	NC_016112	AGGAA	2	10	503077	503086	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1605	NC_016112	T	6	6	503353	503358	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1606	NC_016112	AGC	2	6	503398	503403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1607	NC_016112	G	6	6	503421	503426	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_016112	C	6	6	503470	503475	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1609	NC_016112	T	6	6	503851	503856	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1610	NC_016112	AGC	2	6	503896	503901	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1611	NC_016112	CAA	2	6	503999	504004	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1612	NC_016112	CAG	2	6	504979	504984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1613	NC_016112	GGA	2	6	505084	505089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1614	NC_016112	CGG	2	6	505095	505100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1615	NC_016112	CAT	2	6	505199	505204	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1616	NC_016112	GGA	2	6	505294	505299	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_016112	CGG	2	6	505305	505310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1618	NC_016112	CAT	2	6	505409	505414	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1619	NC_016112	CGG	2	6	505500	505505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1620	NC_016112	CGG	2	6	505515	505520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1621	NC_016112	CAT	2	6	505619	505624	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1622	NC_016112	GGA	2	6	505713	505718	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1623	NC_016112	CGG	2	6	505724	505729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1624	NC_016112	CAT	2	6	505828	505833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1625	NC_016112	GGA	2	6	505922	505927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_016112	CGG	2	6	505933	505938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1627	NC_016112	CAT	2	6	506037	506042	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1628	NC_016112	G	7	7	506102	506108	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
1629	NC_016112	CCAT	2	8	506121	506128	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1630	NC_016112	CAC	2	6	506143	506148	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1631	NC_016112	CTTAA	2	10	506155	506164	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1632	NC_016112	A	6	6	506170	506175	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1633	NC_016112	CA	3	6	506250	506255	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1634	NC_016112	GTG	2	6	507850	507855	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1635	NC_016112	CTT	2	6	507940	507945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1636	NC_016112	AATG	2	8	507956	507963	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
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